Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf8Q9EQH4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf8Q9EQH4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms