Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms