Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r54Q9EPB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r54Q9EPB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms