Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aph1cQ9DCZ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms