Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx6Q9DBY5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms