Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms