Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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