Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop5Q9DB28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms