Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700012A03RikQ9DAF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms