Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc89Q9DA73 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms