Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmco5aQ9D9D5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms