Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi35Q9D8C4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi35Q9D8C4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi35Q9D8C4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ifi35Q9D8C4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi35Q9D8C4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ifi35Q9D8C4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Ifi35Q9D8C4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi35Q9D8C4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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