Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arpc5lQ9D898 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc5lQ9D898 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms