Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnajc4Q9D844 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dnajc4Q9D844 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms