Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms