Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4cQ9D7F7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms