Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms