Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cmtm5Q9D6G9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms