Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms