Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm20lQ9D4V6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm20lQ9D4V6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms