Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms