Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf6Q9D4J7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms