Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Efhd1Q9D4J1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efhd1Q9D4J1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Efhd1Q9D4J1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Efhd1Q9D4J1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms