Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcc1Q9D4H2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcc1Q9D4H2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms