Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
4933415A04RikQ9D443 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933415A04RikQ9D443 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms