Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap53Q9D439 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms