Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus10Q9D3U0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms