Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx29Q9D3S3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms