Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag1Q9D3E6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms