Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy3Q9D394 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms