Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms