Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms