Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm12Q9D0R8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms