Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkapQ9D0F4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms