Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbdc1Q9D0B6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pbdc1Q9D0B6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms