Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms