Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp11Q9CZJ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp11Q9CZJ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms