Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thumpd2Q9CZB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thumpd2Q9CZB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms