Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms