Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm6Q9CZ69 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms