Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snf8Q9CZ28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snf8Q9CZ28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms