Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms