Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChtopQ9CY57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChtopQ9CY57 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChtopQ9CY57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChtopQ9CY57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChtopQ9CY57 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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