Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm8Q9CXT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm8Q9CXT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm8Q9CXT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms