Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd8Q9CX56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms