Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BccipQ9CWI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms