Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn3Q9CVD2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms