Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gdpd1Q9CRY7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd1Q9CRY7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd1Q9CRY7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdpd1Q9CRY7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd1Q9CRY7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Gdpd1Q9CRY7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd1Q9CRY7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd1Q9CRY7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd1Q9CRY7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gdpd1Q9CRY7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.4 ms