Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms