Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exosc5Q9CRA8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exosc5Q9CRA8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms